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一场关于基因测序的“无限战争”来了!

作者:三青 时间:2023-06-11 阅读数:人阅读

 

当众人将灭霸控制住后

螳螂女开始触碰灭霸的大脑……

我紧紧地抓住了

这个镶嵌了6颗无限宝石的手套

 

星爵你别激动,就要成功了,

无限手套我就要扒下来了……

Oh no....

从睡梦中惊醒,Oh,我居然变成了蜘蛛侠,基因变异了的超级英雄……坐在床头,继续回味着梦里的我。

“如果成了超人,我就可以惩恶扬善,拯救全世界,赢取白富美,走上人生巅峰。想想还有点小激动呢。”

上面说到蜘蛛侠是基因突变造就的英雄,而我所从事的基因检测工作则是针对基因的一项研究。虽然还做不到把人改造成超级英雄,但基因检测已进入实用阶段,说到这里,我想给大家讲讲关于基因检测的那些事儿~

基因是什么?

来来来,我们重温一下高中生物学:

人类基因组,由23对染色体组成,其中包括22对体染色体、1对性染色体(男性为XY,女性为XX) 。

人类基因组含有约31.6亿个DNA碱基对,碱基对是以氢键相结合的两个含氮碱基,以胸腺嘧啶(T)、腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)和鸟嘌呤(G)四种碱基排列成碱基序列,其中A与T之间由两个氢键连接,G与C之间由三个氢键连接,碱基对的排列在DNA中也只能是A对T,G对C……

这位同学,先别晕,醒醒醒醒,我们继续

(此处略过3万字...)

基因检测又是什么?

基因检测是通过血液、其他体液、或细胞对DNA进行检测的技术,分析DNA所含有的基因类型和基因缺陷及其表达功能是否正常的一种方法。

举个栗子

经常被工作掏空的程序员,应当去医院做一个心脑血管疾病的基因检测,如果发现自己有遗传性心律失常的基因(猝死的概率比较高)的话,就应适当地减少工作量,多花点时间去寻找自己的诗和远方~

基因检测的主要用途有辅助临床诊断,指导治疗,携带者筛查,指导生育,为造血干细胞移植提供精确的配型信息等。

基因检测怎么了?

01

面临计算能力的挑战

测序仪器技术飞速发展,测序原始数据量大幅度提升,使得基因测序行业从原来的“测的没有算的快”,变为“算的没有测的快”

02

数据分析,解读效率低

传统IT计算能力针对单人全测序产生的数据进行分析和解读,每次计算需要数天时间。

03

投资高,部署复杂

IT基础设施成本居高不下,整体IT集群的建设、部署、维护、运营、扩容等非常复杂。

04

数据的存储成为瓶颈

1个人的数据为1.5TB,100万人的数据将有1EB;这么大数据的传输、共享,存储成本,I/O读取性能,都会成为业务发展的瓶颈。

怎么解决呢?

基因测序作为高性能计算的重要应用领域之一,华为高性能计算云解决方案可以为基因测序应用提供端到端的计算服务:

具体的解决方案有以下几点:

灵活弹性的高性能云服务器:满足不同HPC应用对计算、内存的配比需求。

卓越性能的裸金属服务器满足HPC业务按需灵活弹性的需求。

丰富的高性能分布式存储满足用户不同的数据需求。

Lustre高性能并行文件系统:满足HPC极致的文件系统性能要求。

分布式可扩展的块存储服务:可按需挂载云硬盘,为HPC计算节点和存储节点提供存储空间。

看完我的介绍,是不是也觉得基因检测是一件能造福人类的事情呢? 有了华为云为这个行业提供技术支持,我们就能更加聚焦地去攻克专业难题,说不定有一天我们就会研究出能将人变成超级英雄的方法呢~

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